La Faculté de Théologie est dirigée par le Doyen, assisté du vice-doyen.
Les instances qui l'animent sont :

• Le Conseil de Faculté.
• L'Assemblée statutaire des enseignants.
• L'Assemblée générale du corps enseignant.
• La Commission paritaire de gestion, composée du doyen, du vice-doyen, et à parité de délégués enseignants et de délégués étudiants. 

Doyen : Abbé Philippe CURBELIE, reçoit sur rendez-vous.

Vice-doyen : Mme Bernadette ESCAFFRE

Directeurs d'études :

1) Cycle d'introduction " In-Théo" : Mme Geneviève MARCHAND

2) Cycle de Baccalauréat canonique

Cycle A (licence à temps plein) :

• 1ère année : Abbé Grégory WOIMBÉE
• 2e année : Abbé Grégory WOIMBÉE
• 3e année : Abbé Grégory WOIMBÉE

Cycle B (Licence à temps partiel) : Abbé Jean-François GALINIER-PALLEROLA
                                                    Père Tanguy-Marie POULIQUEN
Cycle C (Licence en parcours du soir) : Mme Bernadette ESCAFFRE

2) Cycle de Licence canonique (1ère et 2e années) : M. Philippe MOLAC, p.s.s.

3) Cycle de Doctorat : Père Henry DONNEAUD, o.p.

4) Section des Langues et TEB : Mme Danielle ELLUL

Secrétariat universitaire :

Mme Béatrice ESCASSUT (TEB)
Mme Dorothée FOURNIER